Театр
Свою карьеру Филипп Авдеев начинал в 2001 году как актер мюзикла «Норд-Ост». Юному актеру довелось принять участие в трагических событиях, связанных с захватом заложников на Дубровке во время представления мюзикла 23 октября 2002 года. Для Филиппа тогда все обошлось благополучно – ему удалось убежать через решетчатую ограду театра.
В «Норд-Осте» Филипп Авдеев проработал до 2003 года, а затем перешел в Московский музыкальный театр юного актера.
Кино
В 2004 году Филипп Авдеев дебютировал на киноэкране. Он сыграл одну из главных ролей в приключенческой ленте режиссера Евгения Соколова «Тайна Голубой долины». Герой Филиппа Артем вместе с двумя другими подростками оказываются одни в таинственной Голубой долине, где им предстоит пережить массу приключений, встретить современного Маугли и спасти его от охотников за «снежным человеком»... В том же 2004 году Филипп Авдеев снялся еще в одной ленте Евгения Соколова – «Надежда уходит последней,, где сыграл роль Пети Шахновского.
Самой известной работой юного актера на сегодняшний день стала роль Костика из детского фантастического фильма Олега Компасова «Азирис Нуна» (2006). Фильм, снятый по роману Юлия Буркина и Сергея Лукьяненко «Сегодня, мама!» рассказывает об увлекательном путешествии во времени и пространстве двух братьев-подростков.